AI背景下对复杂群落的求解策略——初识MetaIBM有感


419日下午,系里举办了一次专业培养小型师生交流会,除了我们2023级生态学专业全体本科生之外,专业负责人韩博平教授还邀请了几位优秀的研究生学长参加。林键濠学长与我们分享的,是他基于Python开发的MetaIBM个体建模库(Individual-Based Model, IBM),这个研究成果已经发表于国际权威期刊《Ecological Modelling》(2024年)。论文提出了一种用于模拟自然集合群落的工具MetaIBM。其中,集合群落景观及其环境梯度等可以自主灵活设计,支持用户根据自己的需求来选择性地设置参数,控制生态过程,以此来解决广泛的生态问题。论文通过四个场景(中性假设、生态位假设、缓慢进化场景、快速进化场景)演示如何使用MetaIBM设计和建模集合群落。实例表明,MetaIBM能够有效地拟合群落,揭示出在多尺度进化过程和扩散过程相互作用下的物种多样性模式。这引起了我们的浓厚兴趣。会后,我们通过系统研读论文原文、反复观看学长录制的解析视频,逐步厘清了这一研究的创新动机、模拟算法设计逻辑及跨尺度生态预测的应用优势(分层阐述学习路径),对理论模型落地潜力有了更进一步的理解。在此分享我们的心得,希望与同学们一道努力!

1:研究论文“MetaIBM: A Python-based library for individual-based modelling of 

eco-evolutionary dynamics in spatial-explicit metacommunities”的标题、关键词及摘要


2:针对4场景进行设计和建模。在初始化之后,该模拟在一个时间步长内按顺序运行了定殖、

自然选择、繁殖和突变、扩散、萌发和干扰过程的子模型








图文| 2023级生态学专业本科生  郑镶宇、何一鸣、王琪

初审| 戴玉女、韩博平

终审| 许德麟






 
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